Skupina Excavata
Zahrnuje mnohé bývalé prvoky řazené tradičně mezi bičíkovce (Flagellata, Mastigophora). Název je odvozen ze žlábku na spodině buňky, sloužícího k příjmu částic potravy přiháněných bičíky (lat. cavum = dutina). Typickým znakem většiny zástupců je přítomnost jednoho či několika bičíků. Jedná se o tzv. tažný bičík na rozdíl od tlačného bičíku spermií živočichů. Někteří mají bičík probíhající podél buňky, s níž je spojen cytoplazmatickou blankou, jež vytváří undulující membránu (membrana undulans).
Obr. Schéma bičíku, který je na průřezu tvořený 10 páry mikrotubulů uspořádaných do struktury 9 + 1, tedy devět párů mikrotubulů po obvodu (C) a jeden pár mikrotubulů uprostřed (A). Mikrotubuly jsou vzájemně propojeny asociovanými proteiny. Pro pohyb bičíku je důležitý protein dynein (B), označovaný jako tzv. molekulový motor, který se může za spotřeby energie pohybovat po sousedních mikrotubulech a tím měnit tvar bičíku, což umožňuje jeho ohýbání a tím i pohyb (Obr. EB).
Veterinárně významné druhy jsou zahrnuty ve čtyřech kmenech:
Příslušníci tohoto kmene se vyznačují anaerobním metabolismem a postrádají mitochondrie, což bylo dříve pokládáno za doklad jejich dávného vzniku ještě před sériovou endosymbiózou. Poté, co u nich byly nalezeny zbytky mitochondriálních genů a enzymů, je evidentní, že zde mitochondrie původně byly a teprve sekundárně došlo k jejich ztrátě, a jejich dříve předpokládaná starobylost tím byla vyvrácena. Pozůstatkem mitochondrií jsou drobné organely zvané mitosomy.
Příslušníci řádu diplomonády (Diplomonadida) obsahují 2 sady organel; mají tedy 2 jádra a párové bičíky.
Giardia intestinalis (dříve Lamblia podle svého objevitele, českého lékaře D. Lambla) je ve skutečnosti komplexem nejméně 7 morfologicky nerozlišitelných druhů. Je opatřena 8 bičíky a adhezivním diskem, kterým se přichycuje na epitel tenkého střeva. Kromě vegetativních stadií (trofozoity) vytváří cysty, které můžeme prokázat v trusu. Přenos se děje obvykle cystami vypitými s vodou. Giardie jsou extracelulárními parazity člověka a řady druhů zvířat, např. psů. Mohou vyvolávat průjmy - giardióza je v ČR nejčastější střevní protozoózou člověka.